More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2240 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  100 
 
 
262 aa  520  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  46.96 
 
 
255 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  43.62 
 
 
260 aa  216  2.9999999999999998e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 
261 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 
256 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  41.2 
 
 
271 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  41.73 
 
 
286 aa  185  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
263 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  42.74 
 
 
256 aa  178  5.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  41.13 
 
 
259 aa  176  5e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.43 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
269 aa  168  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 
265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.68 
 
 
254 aa  160  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
257 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  32.81 
 
 
263 aa  158  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  158  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  32.81 
 
 
263 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
266 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
264 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  32.41 
 
 
263 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 
263 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
254 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  32.41 
 
 
263 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
249 aa  152  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.55 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.02 
 
 
263 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  36.15 
 
 
254 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 
263 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 
263 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  32.28 
 
 
265 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.74 
 
 
255 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 
263 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
246 aa  145  6e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.89 
 
 
246 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  40.96 
 
 
253 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
292 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  38.11 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 
257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  32.42 
 
 
278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
262 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
290 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
260 aa  137  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  38.19 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  36.29 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
258 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
550 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 
275 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
252 aa  132  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 
290 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.3 
 
 
252 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 
260 aa  131  7.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
248 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 
273 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 
257 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 
265 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  35.22 
 
 
246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  31.78 
 
 
277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.62 
 
 
276 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 
258 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  42.01 
 
 
264 aa  128  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 
249 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.41 
 
 
255 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 
269 aa  126  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
284 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 
272 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
258 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.92 
 
 
242 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 
253 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
281 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 
266 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
249 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
249 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
262 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  38.81 
 
 
252 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  28.63 
 
 
273 aa  122  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.77 
 
 
295 aa  122  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
265 aa  122  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 
272 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  34.52 
 
 
249 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>