More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9117 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  100 
 
 
252 aa  502  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  61.18 
 
 
238 aa  289  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
249 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
249 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  46.18 
 
 
253 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  45.31 
 
 
257 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  43.27 
 
 
259 aa  168  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  41.42 
 
 
270 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
286 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
264 aa  162  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
308 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
324 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  42.19 
 
 
260 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  42.17 
 
 
246 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  41.74 
 
 
253 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  40.34 
 
 
267 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 
264 aa  158  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  41.52 
 
 
258 aa  158  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  41.28 
 
 
276 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  41.6 
 
 
254 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  39.08 
 
 
299 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  40.95 
 
 
234 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  40.95 
 
 
234 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  40.95 
 
 
234 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  40.95 
 
 
249 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  41.95 
 
 
264 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
248 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
272 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  42.13 
 
 
215 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.49 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  41.22 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  37.71 
 
 
242 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  36.82 
 
 
272 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  36.07 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  39.48 
 
 
256 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  33.33 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 
257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.8 
 
 
246 aa  126  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.38 
 
 
254 aa  126  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 
256 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
246 aa  126  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  38.02 
 
 
266 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.19 
 
 
255 aa  125  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 
259 aa  125  7e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  39.45 
 
 
266 aa  123  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 
251 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
258 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  38.81 
 
 
262 aa  122  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
268 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
256 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
268 aa  122  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  35.34 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.81 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  34.08 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
249 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.7 
 
 
284 aa  120  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  32.37 
 
 
263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
317 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  32.37 
 
 
263 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 
252 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
279 aa  118  7.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  36.53 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  34.54 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  31.76 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  32.16 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  31.76 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  32.16 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  32.16 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  32.16 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  32.16 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
269 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
269 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
270 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  34.16 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
270 aa  115  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>