More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2713 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 281 aa  577  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  78.74 
 
 		 288 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.87 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  30.68 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.56 
 
 		 262 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.62 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.37 
 
 		 257 aa  119  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 268 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.71 
 
 		 255 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 299 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 260 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.23 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.59 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  32.02 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  31.63 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.32 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 276 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1638  transcriptional regulator IclR-like protein  36.49 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318022  normal  0.187362 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.51 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7060  IclR family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 280 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.579294  normal  0.280018 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 262 aa  106  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.1 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 250 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 260 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  34.6 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.32 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 273 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.08 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  31.48 
 
 		 246 aa  102  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.06 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.06 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 268 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.38 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  28.06 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  28.4 
 
 		 351 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  28.06 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.06 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.06 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.06 
 
 		 271 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02174  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1410  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02133  hypothetical protein  28.89 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1401  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.509968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3389  transcriptional regulator, IclR family, C-terminal domain  28.44 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2402  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2390  IclR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 258 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.37 
 
 		 277 aa  99.8  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.11 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  27.98 
 
 		 275 aa  99.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.41 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.67 
 
 		 271 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 258 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 238 aa  99  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 254 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.4 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>