More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0041 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  592  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  78.74 
 
 		 281 aa  421  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  30.89 
 
 		 255 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.95 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  29.48 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 275 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  29.67 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.61 
 
 		 254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.19 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 257 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  30.27 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  28.46 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 260 aa  112  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.24 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 299 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 250 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.6 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  30.63 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  30.14 
 
 		 255 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.16 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 249 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.99 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.68 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.37 
 
 		 246 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 276 aa  103  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 262 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 260 aa  102  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  28.52 
 
 		 258 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  33.33 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 260 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  25.64 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 254 aa  99.4  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  25.64 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.07 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.07 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.07 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.07 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.07 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.17 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0645  transcriptional regulator, IclR family  31.94 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  25.64 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 263 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.07 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.5 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2532  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 260 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.221562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 258 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2636  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.982011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2520  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2477  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2428  putative transcriptional regulator  30.98 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6477  regulatory protein, IclR  28.24 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 257 aa  94.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  25.78 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  25.86 
 
 		 280 aa  93.2  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.1 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 263 aa  93.2  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  28.37 
 
 		 249 aa  92.8  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  25.39 
 
 		 260 aa  92.8  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.92 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 264 aa  92.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 253 aa  92.4  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 238 aa  92.4  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  30.56 
 
 		 267 aa  92  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>