More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4521 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
299 aa  584  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  88.8 
 
 
250 aa  434  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  75.6 
 
 
250 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  74 
 
 
250 aa  378  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  74.4 
 
 
250 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  43.72 
 
 
252 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  44.53 
 
 
254 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  44.13 
 
 
254 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6222  IclR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
269 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  44.13 
 
 
254 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  46.18 
 
 
294 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  45.74 
 
 
278 aa  202  8e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
274 aa  201  9e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  47.33 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  45.15 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  46.4 
 
 
278 aa  198  9e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  43.09 
 
 
254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0697  IclR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
293 aa  196  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.734635  decreased coverage  0.00216711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  45.75 
 
 
258 aa  191  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  45.76 
 
 
275 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  45.29 
 
 
271 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5946  IclR family transcriptional regulator  42.21 
 
 
266 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0417  IclR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
252 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0284942  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
257 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  40.57 
 
 
254 aa  170  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  37.82 
 
 
260 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13880  transcriptional regulatory protein, IclR family  40.59 
 
 
267 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176969  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
260 aa  162  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0296  transcriptional regulator IclR-like protein  34.3 
 
 
252 aa  160  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4954  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
265 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  36.84 
 
 
254 aa  156  4e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1785  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
272 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0108149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
272 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1433  IclR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
255 aa  151  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 
252 aa  150  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  38.91 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  39.27 
 
 
260 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  41.42 
 
 
276 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6149  IclR family transcriptional regulator  36.48 
 
 
261 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.508102  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.88 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
262 aa  138  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  33.89 
 
 
257 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
267 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
256 aa  136  4e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.28 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  34.82 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.41 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
259 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.71 
 
 
256 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 
264 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
260 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.86 
 
 
277 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.81 
 
 
277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.07 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
258 aa  129  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  38.75 
 
 
265 aa  129  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  39.83 
 
 
550 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 
248 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
260 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1070  regulatory proteins, IclR  35.35 
 
 
205 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.43 
 
 
260 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  36.55 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  30.45 
 
 
277 aa  125  6e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.2 
 
 
271 aa  125  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 
257 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 
259 aa  125  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 
281 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
277 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.47 
 
 
255 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 
261 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
273 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  29.22 
 
 
280 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  29.22 
 
 
280 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  29.22 
 
 
280 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
260 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
276 aa  122  5e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  36.14 
 
 
262 aa  122  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
254 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  39.11 
 
 
261 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.51 
 
 
265 aa  122  8e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 
260 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  37 
 
 
290 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  39.17 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  34.31 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.02 
 
 
252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  32.73 
 
 
257 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.03 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.52 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.52 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.52 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.52 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>