More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1052 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 261 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0408  IclR family transcriptional regulator  46.37 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.317858  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  37.09 
 
 		 261 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 		 256 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 260 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 250 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  29.96 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  34.98 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.67 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 280 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  35.62 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 250 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0041  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.88 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.92 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  32.3 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 		 260 aa  105  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  32.3 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 257 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.41 
 
 		 277 aa  105  9e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.86 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 249 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.62 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  31.78 
 
 		 251 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  29.88 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.84 
 
 		 265 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 276 aa  101  9e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  35.91 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.86 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.86 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.86 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  29.3 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.86 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.86 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  29.05 
 
 		 295 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.05 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 281 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 263 aa  99  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 253 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.47 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  30.05 
 
 		 256 aa  98.2  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  34.95 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>