More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4749 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 253 aa  490  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  55.56 
 
 		 259 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  56.83 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  53.56 
 
 		 248 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  49.79 
 
 		 249 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  47.39 
 
 		 270 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  49.79 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  49.79 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  49.79 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  49.3 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  49.07 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  46.58 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  41.74 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  43.03 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  42.92 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.04 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  41.3 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  40.57 
 
 		 284 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  39.75 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 252 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 258 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.23 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 262 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  38.53 
 
 		 264 aa  125  9e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  40.34 
 
 		 277 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  36.25 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 276 aa  123  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 268 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  35.71 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.61 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  30.49 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.89 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  33.93 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  34.8 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  39.61 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  33.93 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.25 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  25.42 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  30.96 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  33.51 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 250 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  31.54 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  31.54 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.54 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  34.65 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.39 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  34.2 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  36.6 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 250 aa  106  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>