More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0434 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 284 aa  560  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  62.7 
 
 		 272 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  46.85 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  45.38 
 
 		 256 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  42.51 
 
 		 248 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  40.59 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  37.65 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  34.13 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  39.18 
 
 		 259 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  41.8 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 279 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  33.19 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.8 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 264 aa  122  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3839  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3485  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 276 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  35.1 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  35.98 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 238 aa  112  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  35.57 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  35.57 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  35.57 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4100  IclR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 239 aa  106  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  32.77 
 
 		 242 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4044  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.69 
 
 		 266 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.77 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 257 aa  99  8e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 262 aa  98.6  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 256 aa  97.4  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 270 aa  95.9  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.51 
 
 		 246 aa  94  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 281 aa  93.6  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  30.36 
 
 		 259 aa  93.6  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 267 aa  93.2  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 270 aa  92.4  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0531  regulatory protein, IclR  33.52 
 
 		 215 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.22 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  31.02 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.45 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  30.31 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  31.4 
 
 		 254 aa  88.6  9e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  30 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.66 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.08 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 269 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 268 aa  85.9  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 267 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  29.67 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 270 aa  85.5  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 250 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.38 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.59 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  29.15 
 
 		 286 aa  85.1  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  24.69 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 269 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4081  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 286 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  33.91 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.45 
 
 		 278 aa  82.4  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 324 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>