More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3345 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009468  Acry_3345  regulatory protein, IclR  100 
 
 		 269 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5057  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.864293  normal  0.0584294 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3542  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4726  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5378  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 295 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.60703 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3637  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792944  normal  0.338947 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3948  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 288 aa  106  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.026727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 275 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0751  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 292 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.388214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  28.46 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4432  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 292 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.560872  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3216  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  34.96 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0309  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 286 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 271 aa  99.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 254 aa  99.4  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.88 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0890  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 304 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2154  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 256 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.935715 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 274 aa  95.9  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6631  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 281 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000095727  normal  0.978308 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 275 aa  95.5  9e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  26.09 
 
 		 252 aa  95.5  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4440  regulatory protein IclR  28.63 
 
 		 276 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 261 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 		 254 aa  93.6  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 275 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  30.58 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 267 aa  92.4  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 277 aa  92  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3204  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 275 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  29.02 
 
 		 275 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2114  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.95 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.247685  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1491  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1811  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0797  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.95 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0639  transcriptional regulator PcaR, putative  28.57 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  24.18 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3116  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.22 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  29.2 
 
 		 303 aa  90.5  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0480  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.14 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0382  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  28.14 
 
 		 261 aa  89.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  29.64 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0601  putative transcriptional regulator PcaR  28.57 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 259 aa  89  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  24.19 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  30.73 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2609  IclR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 256 aa  89  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal  0.0160268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.2 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  23.2 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 		 249 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 252 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0434  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4612  IclR family transcriptional regulator family  31.36 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4627  regulatory protein, IclR  30.91 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 324 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2404  regulatory proteins, IclR  28.63 
 
 		 275 aa  87  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.187611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1795  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 271 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0248874  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0876  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 295 aa  85.9  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.06 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5934  regulatory protein, IclR  27.06 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 268 aa  85.5  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.15 
 
 		 257 aa  85.5  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2525  transcriptional regulator, IclR family  27.24 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2127  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.3 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1375  pca regulon regulatory protein  27.6 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.162445 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1123  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.92 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4348  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  27.6 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.974938  normal  0.0336257 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  25.54 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>