More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2078 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 270 aa  527  1e-149  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 250 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 250 aa  145  9e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 250 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 250 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  33.47 
 
 		 255 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  34.32 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.27 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 275 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.26 
 
 		 252 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  29.6 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  34.58 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 265 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 294 aa  104  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 285 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.99 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.19 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  35.46 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  37.39 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.31 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  32.81 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  102  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  36.41 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  35.9 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3768  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.8 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2460  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 263 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 		 278 aa  98.6  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 249 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2255  transcription regulator protein  30.71 
 
 		 275 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  35.75 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  33.96 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 284 aa  98.2  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  35.75 
 
 		 233 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4718  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 275 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.46 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  30.87 
 
 		 254 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  36.2 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4271  IclR family transcriptional regulator family  31.8 
 
 		 284 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2997  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5369  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4901  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  34.74 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25.6 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 275 aa  96.3  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 284 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 278 aa  95.9  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26 
 
 		 249 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.46 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>