More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0314 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0314  transcriptional regulator IclR-like protein  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.196437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5250  IclR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0713  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 276 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.152863 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7131  IclR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 262 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 261 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0194  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 		 292 aa  102  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0903072  decreased coverage  0.000072825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1941  IclR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 280 aa  102  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000383079  normal  0.111548 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  29.7 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0203  IclR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 304 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.670577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3121  transcriptional regulator, IclR family  29.21 
 
 		 250 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3122  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 250 aa  99  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.255406  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  29.54 
 
 		 256 aa  99  7e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 254 aa  99  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2811  IclR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.667309  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  28.71 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2147  transcriptional regulator, IclR family  26.89 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 		 277 aa  96.7  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 250 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3098  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 250 aa  96.3  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0903257  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 259 aa  95.5  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.39 
 
 		 255 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 258 aa  94.4  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 268 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 258 aa  89.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 257 aa  89.7  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 254 aa  89.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 280 aa  89.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.68 
 
 		 275 aa  89  8e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 260 aa  89  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.21 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  30.31 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  25.93 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2335  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 260 aa  86.3  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  28.69 
 
 		 273 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  31.71 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  25.41 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  28.38 
 
 		 249 aa  85.5  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  26.41 
 
 		 262 aa  85.5  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 242 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  26.76 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0160  transcriptional regulator, IclR family  28.94 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.12 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  27.56 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  25.11 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2380  IclR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.610686  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  30.56 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  28.11 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 283 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1041  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0399426 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  23.46 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3350  transcriptional regulator IclR  27.49 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.618767 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  29.09 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3974  transcriptional regulator, IclR family  25.21 
 
 		 266 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.482822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  24.43 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.57 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  28.12 
 
 		 261 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  24.05 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  24.05 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  24.05 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  24.05 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>