More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1900 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1900  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.417398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1920  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1966  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
233 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2134  regulatory proteins, IclR  89.27 
 
 
233 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4228  regulatory protein, IclR  87.12 
 
 
233 aa  381  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13004  transcriptional regulator  80.69 
 
 
233 aa  346  2e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09050  transcriptional regulator  73.64 
 
 
220 aa  322  3e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.976325  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3216  Transcriptional regulator IclR  73.91 
 
 
244 aa  319  1.9999999999999998e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6007  transcriptional regulator, IclR family  76.74 
 
 
233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2849  transcriptional regulator, IclR family  72.93 
 
 
241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1477  transcriptional regulator, IclR family  68.33 
 
 
237 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.958166  normal  0.570733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1148  IclR family transcriptional regulator  61.06 
 
 
228 aa  247  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.554824  unclonable  0.0000000376636 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5000  transcriptional regulator, IclR family  61.95 
 
 
232 aa  246  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272233  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1257  regulatory protein, IclR  60.62 
 
 
228 aa  244  9e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411018  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  55.98 
 
 
241 aa  237  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4054  transcriptional regulator, IclR family  56.71 
 
 
233 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3464  transcriptional regulator, IclR family  56.58 
 
 
239 aa  231  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0108588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1592  IclR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
238 aa  231  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.885509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8019  putative transcriptional regulator, IclR  55.7 
 
 
238 aa  229  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3299  regulatory proteins, IclR  54.7 
 
 
240 aa  228  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395884  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0625  regulatory proteins, IclR  54.98 
 
 
240 aa  226  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916177  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2358  transcriptional regulator, IclR family  56.09 
 
 
239 aa  225  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8050  transcriptional regulator, IclR family  58.33 
 
 
238 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.960848  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2317  transcriptional regulator, IclR family  56.09 
 
 
239 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18570  transcriptional regulator, IclR family  54.78 
 
 
244 aa  221  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.424296  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1686  transcriptional regulator, IclR family  54.35 
 
 
246 aa  219  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.698509  normal  0.0109367 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11090  transcriptional regulator, IclR family  54.35 
 
 
239 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1572  transcriptional regulator, IclR family  55.22 
 
 
240 aa  218  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.358394  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0184  transcriptional regulator, IclR family  53.33 
 
 
244 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.286529  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1112  IclR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
307 aa  211  7e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1595  IclR-type transcriptional regulator  50.87 
 
 
266 aa  209  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3622  IclR family transcriptional regulator  57.08 
 
 
235 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.464151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08730  transcriptional regulator  51.53 
 
 
258 aa  209  4e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00649547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2257  transcriptional regulator, IclR family  53.7 
 
 
239 aa  208  5e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000173115 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2520  IclR family transcriptional regulator  51.71 
 
 
239 aa  207  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.463274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1357  Transcriptional regulator IclR  54.59 
 
 
238 aa  201  6e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.775388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0276  IclR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
237 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 
252 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
273 aa  105  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3341  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
277 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
273 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4281  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
266 aa  102  6e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0195  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 
277 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4151  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 
264 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.697972  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4039  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 
264 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  34.42 
 
 
272 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4012  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 
254 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
252 aa  98.6  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
272 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  34.76 
 
 
272 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  35.75 
 
 
270 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7080  Transcriptional regulator  30.7 
 
 
231 aa  97.8  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4515  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.390313  normal  0.426328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3984  regulatory proteins, IclR  35.02 
 
 
270 aa  95.9  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.104797  normal  0.0879634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 
266 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.24 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 
266 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
273 aa  92.4  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.58 
 
 
266 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  92  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  35.87 
 
 
270 aa  91.7  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
255 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  29.91 
 
 
251 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.76 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
249 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4142  putative IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000218071  normal  0.711685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.52 
 
 
275 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3208  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.129719  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 
255 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
259 aa  89.7  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
265 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  37.23 
 
 
257 aa  89.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2850  IclR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
250 aa  87.8  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.526346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
283 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  29.91 
 
 
249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3103  transcriptional regulator, IclR family  27.01 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2883  IclR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
250 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0306717  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2968  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.980752  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
269 aa  87  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>