More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4172 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 249 aa  494  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  32.66 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  39.3 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 283 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  35.16 
 
 		 283 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 		 270 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 249 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 256 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 249 aa  95.9  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 249 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 265 aa  95.1  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  32.32 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 246 aa  91.7  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.14 
 
 		 250 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2285  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 259 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 249 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 252 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  27.87 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.2 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 279 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  30.39 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1130  transcriptional regulator, IclR family  30.13 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  21.54 
 
 		 246 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  30.15 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 285 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  27.36 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3302  transcriptional regulator, IclR family  34.33 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.8 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.71 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 261 aa  79  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 260 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1454  IclR family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5781  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.86 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  29.13 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4086  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6216  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121884  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05447  hypothetical protein  23.83 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  26.34 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0530  IclR family transcriptional regulator  20.19 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001509  transcriptional regulator  23.83 
 
 		 244 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.47 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  25.37 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  30.23 
 
 		 278 aa  75.9  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1082  IclR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.400531  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3937  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.793317 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  26.24 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2803  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.323912 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>