More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1684 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 283 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4172  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.102148  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 283 aa  99  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3411  transcription regulator protein  28.24 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.531114 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.12 
 
 		 252 aa  92  9e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  32.02 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4434  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0001758  normal  0.639145 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.1 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  33.17 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  34.41 
 
 		 266 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1499  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 274 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.985089  normal  0.504331 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2746  transcriptional regulator, IclR family  27.78 
 
 		 274 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.881679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1720  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.725475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.84 
 
 		 256 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 252 aa  85.5  8e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5574  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 274 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.154654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0416  regulatory proteins, IclR  21.86 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505949  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  28.12 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 267 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.09 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2369  regulatory proteins, IclR  30.37 
 
 		 287 aa  82  0.000000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.73 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4864  transcriptional regulator IclR  29.82 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.727357  normal  0.5186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0839  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2316  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 246 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.959704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.38 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1930  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0451  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 252 aa  79.7  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2234  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2078  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 270 aa  79.3  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.341471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1950  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.400846  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  26.1 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2228  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.713006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 259 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2914  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0967  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.225684  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0364  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 265 aa  78.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1253  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 249 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  23.15 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1272  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  23.15 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3039  IclR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  23.85 
 
 		 260 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2383  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.151168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.77 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  27.65 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 266 aa  75.9  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 269 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2997  transcriptional regulator, IclR family  26 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000293237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.77 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 286 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.68 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  30 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0162  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 257 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4808  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 273 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.688176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4961  IclR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.790351  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  29.44 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5395  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.374154  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.62 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3729  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5466  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339776  normal  0.216516 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4803  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.898602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5349  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>