More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4884 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4884  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 260 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.574165  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  28.2 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  34.27 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  28.74 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 260 aa  99.4  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.35 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.42 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.7 
 
 		 251 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 260 aa  95.5  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 283 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2392  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2799  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 256 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.91 
 
 		 253 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  27.6 
 
 		 252 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 257 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 261 aa  93.2  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 262 aa  93.2  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 276 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.61 
 
 		 252 aa  92.8  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 260 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5545  regulatory protein, IclR  31.96 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 251 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.34 
 
 		 248 aa  92.8  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 273 aa  92  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 275 aa  91.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.49 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.09 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6466  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 266 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185933  normal  0.684135 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 277 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.02 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.02 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.13 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.42 
 
 		 263 aa  89  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.02 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.02 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.02 
 
 		 263 aa  89.4  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.31 
 
 		 265 aa  88.6  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.59 
 
 		 276 aa  88.6  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4409  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.57 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.42 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2875  IclR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 250 aa  86.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 263 aa  86.7  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 258 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2051  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 249 aa  85.9  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0630504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1239  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  32.59 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 260 aa  85.5  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3296  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 250 aa  85.1  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.89 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  29.96 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.21 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.9 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.91 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  29.91 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.17 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2670  transcriptional regulator, IclR family  29.63 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2360  regulatory proteins, IclR  29.65 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.123058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3089  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4161  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  32.54 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.53 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>