More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09640 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 257 aa  512  1e-144  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  73.03 
 
 		 257 aa  336  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  65.15 
 
 		 248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  62 
 
 		 276 aa  291  7e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  62.35 
 
 		 265 aa  291  9e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  58 
 
 		 251 aa  281  9e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  60.17 
 
 		 256 aa  274  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  56.97 
 
 		 251 aa  274  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  59.83 
 
 		 264 aa  267  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  63.76 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  51.41 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  53.04 
 
 		 254 aa  235  7e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  50.8 
 
 		 264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  55.8 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 259 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  52.67 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  42.69 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  41.3 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  38.62 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  38.62 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  38.62 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 256 aa  145  6e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  37.96 
 
 		 274 aa  145  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  37.45 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  37.55 
 
 		 276 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  35.77 
 
 		 276 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  37.7 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  42.62 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  36.73 
 
 		 275 aa  140  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  40 
 
 		 276 aa  137  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  35.77 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 281 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  36.93 
 
 		 277 aa  135  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  34.98 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.3 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.52 
 
 		 260 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 284 aa  126  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  39.83 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  35.95 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  36.86 
 
 		 273 aa  125  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 257 aa  125  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  34.87 
 
 		 255 aa  123  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  34.39 
 
 		 295 aa  121  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  37.1 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 261 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.07 
 
 		 279 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 282 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 265 aa  119  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 263 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.89 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2370  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  34.76 
 
 		 294 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.01 
 
 		 254 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  36.64 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>