More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2225 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  100 
 
 
249 aa  502  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  57.81 
 
 
276 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  55.97 
 
 
265 aa  272  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  58.37 
 
 
248 aa  272  5.000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  55.95 
 
 
256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  57.27 
 
 
258 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  58.18 
 
 
257 aa  244  6.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  49.79 
 
 
251 aa  238  9e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  53.74 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  55.04 
 
 
257 aa  232  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  47.33 
 
 
251 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  52.42 
 
 
283 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  46.72 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  47.3 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
259 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  44.17 
 
 
264 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  41.77 
 
 
260 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  42.04 
 
 
256 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  38.08 
 
 
255 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  39.04 
 
 
261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
273 aa  152  4e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
267 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
272 aa  149  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  41.74 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
262 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 
252 aa  138  6e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 
265 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.24 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  39.47 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  34.98 
 
 
276 aa  136  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.16 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
276 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 
255 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  34.96 
 
 
274 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 
256 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  34.57 
 
 
277 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
269 aa  132  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  37.92 
 
 
262 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.16 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.16 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 
263 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.16 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 
263 aa  131  9e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 
264 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6015  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.881109  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4028  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  34.02 
 
 
276 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4338  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  31.62 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.49 
 
 
263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 
257 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  33.86 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  33.86 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  33.86 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  33.86 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  33.86 
 
 
274 aa  128  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.75 
 
 
295 aa  128  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34.48 
 
 
252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.58 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.04 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  33.74 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.04 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.02 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 
290 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
284 aa  125  5e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 
263 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  36.12 
 
 
254 aa  125  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  33.47 
 
 
275 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  37.78 
 
 
281 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  36.02 
 
 
260 aa  125  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  32.51 
 
 
319 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
254 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  40.36 
 
 
290 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2067  transcriptional regulator, IclR family  35.45 
 
 
278 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0210028  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 
263 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 
263 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 
263 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 
263 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  32.93 
 
 
277 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 
263 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>