More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4531 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 
283 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  41.22 
 
 
277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  34.6 
 
 
273 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 
265 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  35.5 
 
 
276 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  33.58 
 
 
295 aa  167  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.48 
 
 
261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
273 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
272 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  32.67 
 
 
267 aa  156  4e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
268 aa  156  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 
256 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 
257 aa  155  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.4 
 
 
256 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 
275 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
267 aa  150  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 
257 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
269 aa  148  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  34.84 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
262 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  35.85 
 
 
274 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 
284 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  34 
 
 
252 aa  144  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  35.85 
 
 
274 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  35.85 
 
 
274 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  35.85 
 
 
274 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  35.85 
 
 
274 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 
308 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.83 
 
 
280 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  35.09 
 
 
274 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
282 aa  143  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  36.03 
 
 
277 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  35.6 
 
 
279 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 
254 aa  141  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 
260 aa  142  9e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
260 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  35.22 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  37.4 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  36.78 
 
 
271 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  37.4 
 
 
256 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  34 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  34.24 
 
 
259 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 
260 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 
279 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 
257 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 
260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 
266 aa  138  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 
284 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.48 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.73 
 
 
260 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
260 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  33.88 
 
 
276 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.71 
 
 
290 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
260 aa  136  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  32.06 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  32.83 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  32.83 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  38.6 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  32.83 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 
249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
254 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
259 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32.65 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.95 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  28.06 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  35.27 
 
 
266 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
280 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  31.92 
 
 
276 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  34.41 
 
 
275 aa  128  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.53 
 
 
276 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 
269 aa  125  6e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  31.54 
 
 
276 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
261 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
260 aa  123  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
267 aa  123  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0178  transcriptional regulator, IclR family  32.95 
 
 
281 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4406  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 
258 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 
265 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>