More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2873 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 257 aa  536  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  94.94 
 
 		 257 aa  508  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  54.26 
 
 		 263 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  55.06 
 
 		 260 aa  281  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 260 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  53.44 
 
 		 260 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  53.04 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  53.85 
 
 		 260 aa  265  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 260 aa  260  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 260 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 260 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 259 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  48.43 
 
 		 265 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 261 aa  231  9e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 257 aa  215  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 		 275 aa  154  9e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  36.18 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 255 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  35.04 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.14 
 
 		 256 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.45 
 
 		 255 aa  138  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 262 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 248 aa  135  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.88 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 277 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  30.65 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  36.24 
 
 		 247 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  125  5e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 260 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  30.98 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  30.98 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  30.98 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  30.98 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  30.98 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.44 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.2 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 550 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.2 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.42 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  30.2 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.72 
 
 		 251 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 		 263 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 252 aa  116  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.44 
 
 		 277 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  28.19 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.16 
 
 		 308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.42 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 246 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 266 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  26.59 
 
 		 276 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.23 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0800  transcriptional regulator  27.8 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  29.03 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.47 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>