More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2354 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  60.08 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  61.38 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  57.09 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  53.04 
 
 		 258 aa  259  4e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 251 aa  206  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1371  transcriptional regulator, IclR family  45.75 
 
 		 255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000320522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2842  transcriptional regulator, IclR family  44.31 
 
 		 254 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.50092  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 260 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  33.86 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.62 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  32.65 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  28.68 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.06 
 
 		 280 aa  115  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  32.1 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.23 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  27.16 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  28.8 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  32.93 
 
 		 251 aa  108  8.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  25.62 
 
 		 253 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  32.73 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.98 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 223 aa  98.6  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 265 aa  96.3  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 257 aa  96.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  28.64 
 
 		 247 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4689  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 254 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.55 
 
 		 255 aa  94.7  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.21 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.4 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.58 
 
 		 242 aa  92.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 260 aa  92  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  29.62 
 
 		 308 aa  92  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  27.38 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  27.39 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.61 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2248  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000546627  hitchhiker  0.000278056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 263 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4432  IclR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  27.63 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  29.84 
 
 		 266 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  24.7 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.12 
 
 		 268 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 253 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  29.08 
 
 		 277 aa  89.4  6e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 279 aa  89  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 244 aa  88.6  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  27.05 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  29.2 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2324  regulatory protein IclR  26.23 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000642248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  26.64 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 268 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>