More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1115 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  36.94 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 265 aa  121  7e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  44.03 
 
 		 261 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 260 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  35.09 
 
 		 265 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  45.65 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  45.65 
 
 		 260 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  44.53 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  29.55 
 
 		 254 aa  102  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.37 
 
 		 261 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 259 aa  98.6  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 254 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 260 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 259 aa  95.5  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  34.46 
 
 		 260 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 252 aa  95.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  35.26 
 
 		 251 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 252 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 267 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 265 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  26.03 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.86 
 
 		 252 aa  87.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  29.82 
 
 		 246 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 268 aa  86.3  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 263 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  30.46 
 
 		 263 aa  85.1  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.1 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  25 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  30.11 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  31.79 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  30.11 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  30.11 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  30.11 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  30.11 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.03 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.05 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 261 aa  82.4  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.21 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 260 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.25 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  27.12 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  31.54 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1841  IclR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.292515  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  31.91 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  34.29 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  29.35 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  30.41 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4994  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0276676  normal  0.0169874 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  36.5 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  28.99 
 
 		 290 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  28.67 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  30.22 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 263 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  30.5 
 
 		 266 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  25.81 
 
 		 279 aa  77  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 292 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  25.11 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  26.51 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  32.2 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  25.11 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27200  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 271 aa  75.1  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0677925  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 260 aa  75.1  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 272 aa  75.1  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  23.72 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  23.72 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  23.72 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>