More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27200  transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0677925  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0906  transcriptional regulator, IclR family  54.17 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.900284  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2210  transcriptional regulator, IclR family  44.87 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.871599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01400  transcriptional regulator  44.31 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 261 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 277 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2443  transcriptional regulator, IclR family  36.95 
 
 		 256 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.627463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.2 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.94 
 
 		 252 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  34.87 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  31.84 
 
 		 255 aa  105  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  29.5 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.22 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.22 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 		 257 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 260 aa  102  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.76 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.76 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.76 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.76 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.76 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0373  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0541267 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  26.83 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  28.31 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.65 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 292 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 		 255 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  30.13 
 
 		 295 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 282 aa  99  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  34.9 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  28.51 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.94 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 263 aa  97.8  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  33.18 
 
 		 260 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  30.93 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 249 aa  96.7  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  30.74 
 
 		 293 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  38.68 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 273 aa  95.9  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  35.29 
 
 		 266 aa  95.9  7e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  32.93 
 
 		 262 aa  95.5  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 260 aa  95.5  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  31.05 
 
 		 277 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.76 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.12 
 
 		 252 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 261 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 260 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.35 
 
 		 265 aa  94  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 271 aa  93.2  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 251 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.52 
 
 		 279 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 276 aa  92.8  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.77 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.24 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.18 
 
 		 278 aa  92.4  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  30.49 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.67 
 
 		 260 aa  92  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  34.48 
 
 		 261 aa  91.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.69 
 
 		 277 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  33.47 
 
 		 286 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  28.07 
 
 		 263 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>