More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4911 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 276 aa  541  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  76.54 
 
 		 273 aa  387  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  57.03 
 
 		 350 aa  251  6e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 305 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 324 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  56.63 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 324 aa  250  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  56.63 
 
 		 299 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 317 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  52.87 
 
 		 330 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  52.87 
 
 		 290 aa  239  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  50.62 
 
 		 255 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  50.62 
 
 		 284 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  52.19 
 
 		 261 aa  232  6e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  49.22 
 
 		 269 aa  229  4e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  51.72 
 
 		 261 aa  228  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  47.51 
 
 		 269 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  47.39 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  46.8 
 
 		 261 aa  195  5.000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  41.2 
 
 		 266 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.39 
 
 		 265 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  36.22 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 268 aa  121  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  30.83 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  29.43 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 264 aa  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.69 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 260 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  32.69 
 
 		 286 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  32.75 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.81 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 252 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 308 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 286 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 248 aa  108  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 272 aa  108  8.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 283 aa  108  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  31.88 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  31.88 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  31.88 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  31.88 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  31.88 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  33.1 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 260 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 251 aa  106  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.83 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  38.36 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.76 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  27.86 
 
 		 257 aa  105  9e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 263 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.97 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.92 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  32.27 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.79 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.14 
 
 		 255 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 264 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  35 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  31.9 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  32.99 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>