More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0541 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 261 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  51.36 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  53.63 
 
 		 273 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 276 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 365 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  51.63 
 
 		 299 aa  215  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 299 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  46.83 
 
 		 267 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 305 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 300 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 300 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  48.78 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 350 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  48.37 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  44.84 
 
 		 269 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  44.84 
 
 		 269 aa  205  7e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  48.18 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 290 aa  203  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  43.1 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  43.1 
 
 		 284 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  43.25 
 
 		 261 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  39.06 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  41.84 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.58 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.75 
 
 		 256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.71 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 264 aa  119  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  31.08 
 
 		 265 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.85 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 277 aa  112  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.47 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.84 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.58 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 249 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 257 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  35.68 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  32.11 
 
 		 276 aa  99.8  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 248 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  33.05 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  28.68 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 256 aa  99  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 290 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 260 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 264 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  29.02 
 
 		 260 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.42 
 
 		 263 aa  97.1  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  29.72 
 
 		 265 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 264 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.52 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  29.22 
 
 		 271 aa  96.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  30.12 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>