More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4121 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  81.32 
 
 		 269 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  81.18 
 
 		 269 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 299 aa  295  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  58.87 
 
 		 317 aa  293  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 299 aa  291  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  60.24 
 
 		 365 aa  288  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  57.79 
 
 		 330 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 305 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 300 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 350 aa  286  2e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 300 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 324 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  59.84 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 324 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  59.44 
 
 		 324 aa  285  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  57.41 
 
 		 290 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  59.84 
 
 		 299 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  51.89 
 
 		 255 aa  249  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  51.89 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  53.52 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  51.59 
 
 		 273 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  43.3 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  46.83 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  47.47 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  32.16 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  31.76 
 
 		 278 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.81 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 248 aa  112  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 261 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.18 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  29.1 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  28.73 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  27.61 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 282 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.62 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  29.67 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  27.61 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  27.61 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  27.61 
 
 		 270 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 270 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  31.35 
 
 		 267 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  28.3 
 
 		 265 aa  99.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 261 aa  99  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  27.31 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.07 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  27.61 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.96 
 
 		 265 aa  98.6  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.3 
 
 		 271 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 267 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 276 aa  97.8  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  27.61 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  27.61 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  27.61 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  27.61 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  34.13 
 
 		 299 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 269 aa  96.7  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.41 
 
 		 263 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  33.48 
 
 		 249 aa  96.3  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  27.8 
 
 		 263 aa  96.3  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.8 
 
 		 265 aa  95.5  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.41 
 
 		 263 aa  95.5  8e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.59 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>