More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2181 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 269 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  94.05 
 
 		 269 aa  520  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  81.32 
 
 		 267 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 317 aa  284  9e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 365 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  58.4 
 
 		 299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 305 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 350 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  57.6 
 
 		 299 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 324 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  58.8 
 
 		 324 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  58.8 
 
 		 350 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3415  transcriptional regulator, IclR family  56.06 
 
 		 330 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257423  normal  0.172483 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0542  IclR family transcriptional regulator  56.06 
 
 		 290 aa  279  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  58 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  58 
 
 		 299 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6621  transcriptional regulator, IclR family  53.97 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.104953  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03724  putative transcriptional regulator  54.4 
 
 		 255 aa  249  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4214  IclR family transcriptional regulator  54.4 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00389286 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03673  hypothetical protein  54.4 
 
 		 284 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  52.78 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  46.59 
 
 		 266 aa  227  2e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4911  IclR family transcriptional regulator  52.16 
 
 		 276 aa  224  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406508  normal  0.192345 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  48.51 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5822  IclR family transcriptional regulator  44.18 
 
 		 294 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  44.84 
 
 		 261 aa  205  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.15 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  33.48 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0724  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0508551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 261 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  32.66 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  35.34 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 238 aa  109  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 256 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.76 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  31.91 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000924  transcriptional regulator KdgR KDG operon repressor  29.66 
 
 		 265 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.06 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  31.35 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  31.66 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.02 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.92 
 
 		 276 aa  102  6e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  34.92 
 
 		 258 aa  101  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.23 
 
 		 263 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.34 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.8 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  28.95 
 
 		 263 aa  99.4  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 265 aa  99  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.91 
 
 		 257 aa  99  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  28.52 
 
 		 263 aa  98.6  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.68 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3482  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  29.17 
 
 		 263 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  34.11 
 
 		 246 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2713  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0235576  normal  0.170928 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4675  transcriptional regulator, IclR family  35.06 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236119  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  28.83 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  30.15 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 275 aa  97.1  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.92 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.92 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.92 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3839  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.92 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.92 
 
 		 263 aa  95.9  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 272 aa  95.5  7e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>