More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0516 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 272 aa  564  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  75.56 
 
 		 272 aa  421  1e-117  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  75.56 
 
 		 272 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  76.17 
 
 		 266 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  76.17 
 
 		 266 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  75.78 
 
 		 272 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  75.78 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  75.78 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  75.78 
 
 		 266 aa  411  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  73.64 
 
 		 282 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 282 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 270 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  73.64 
 
 		 282 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  73.64 
 
 		 282 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  73.64 
 
 		 282 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  73.26 
 
 		 270 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  73.26 
 
 		 270 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  57.47 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3614  transcriptional regulator, IclR family  56.03 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.149687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  32.53 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 263 aa  132  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  32.97 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  28.05 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.21 
 
 		 277 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 259 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 256 aa  125  6e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 265 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  31.6 
 
 		 275 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  34.52 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.48 
 
 		 252 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  33.46 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  33.86 
 
 		 259 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  32.8 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  32.8 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  32.8 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  31.2 
 
 		 274 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  32.21 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  34.68 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.18 
 
 		 277 aa  122  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  31.01 
 
 		 277 aa  122  9e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  31.35 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.67 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  32.42 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30.95 
 
 		 268 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  31.1 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.56 
 
 		 274 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 270 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 299 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 279 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 365 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.25 
 
 		 276 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.28 
 
 		 252 aa  115  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 		 290 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>