More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3614 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3614  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 268 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.149687  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  62.45 
 
 		 266 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  62.45 
 
 		 266 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  62.45 
 
 		 266 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  62.45 
 
 		 266 aa  322  3e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  62.06 
 
 		 266 aa  321  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 270 aa  315  7e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  60.47 
 
 		 282 aa  314  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 282 aa  314  9e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 282 aa  314  9e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  58.11 
 
 		 282 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  58.11 
 
 		 282 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  59.23 
 
 		 270 aa  313  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  58.85 
 
 		 270 aa  311  9e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  57.31 
 
 		 272 aa  293  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  56.03 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  57.31 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 272 aa  292  5e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0758  IclR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 262 aa  273  3e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00765311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  37.99 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 256 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  29.55 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  34.55 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1205  IclR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230361  normal  0.161906 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  34.55 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  32.68 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 265 aa  109  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2099  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 257 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.734801  normal  0.3554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 262 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  32.74 
 
 		 277 aa  106  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  33.18 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  33.64 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  33.18 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  33.18 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  33.18 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  33.64 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  32.88 
 
 		 308 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  33.18 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  33.64 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  30.54 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 257 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  33.2 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  105  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  32.73 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  33.77 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.75 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.75 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.75 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  32.82 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  31.75 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  32.82 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.75 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 270 aa  102  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 259 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.75 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  31.75 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.41 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  31.75 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 270 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  31.01 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  28.14 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  27.41 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  32.75 
 
 		 277 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>