More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4215 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 261 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  52.21 
 
 		 268 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  51.2 
 
 		 293 aa  241  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 266 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  52.23 
 
 		 266 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  48.68 
 
 		 282 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  37.04 
 
 		 265 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  36.53 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  34.67 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  37.5 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.36 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  35.62 
 
 		 252 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  31.39 
 
 		 264 aa  124  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 253 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1486  transcriptional regulator, IclR family  35.69 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  38.03 
 
 		 249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.29 
 
 		 261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 259 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  31.85 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  36 
 
 		 280 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 279 aa  116  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 261 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4893  transcriptional regulator, IclR family  35.54 
 
 		 262 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.22 
 
 		 265 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.05 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3711  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  33.79 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.93 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.84 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.19 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  35.92 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  32.44 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2939  transcriptional regulator, IclR family  38.65 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  31.71 
 
 		 278 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  32.13 
 
 		 254 aa  108  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  35.51 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 257 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  34.88 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  35.71 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 260 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.2 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  35.65 
 
 		 286 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.31 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28.77 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 280 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  32.54 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5933  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.196761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 283 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2170  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 252 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 284 aa  105  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 319 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2822  IclR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0262  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  27.83 
 
 		 303 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5247  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 262 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  35.02 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 282 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1381  transcriptional regulator, IclR family  34.93 
 
 		 259 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0265697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  32.81 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>