More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2053 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  561  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1507  transcriptional regulator, IclR family  43.8 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  40.57 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  39.37 
 
 		 293 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  39.06 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  38.98 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  36.25 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  39.65 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  36.61 
 
 		 256 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  34.73 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 283 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  34.24 
 
 		 277 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  30.62 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 		 256 aa  99.4  6e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.98 
 
 		 261 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.36 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1052  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 261 aa  97.1  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 273 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 259 aa  95.9  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.42 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.54 
 
 		 255 aa  92.8  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 269 aa  92  8e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  30.38 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  30.89 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.86 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 255 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 		 254 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.71 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.32 
 
 		 277 aa  89.4  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 257 aa  89  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4893  transcriptional regulator, IclR family  31.75 
 
 		 549 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.08 
 
 		 258 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 284 aa  88.6  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.18 
 
 		 249 aa  87.8  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 280 aa  87.4  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.47 
 
 		 273 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 276 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 258 aa  85.9  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 		 255 aa  85.5  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  28.31 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2210  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.871599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  27.95 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6634  IclR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0992864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27200  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0677925  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  32.81 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  29.24 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.11 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.45 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  26.34 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2586  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.556667  normal  0.947412 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  24.35 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0381  IclR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.04 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  28.29 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 257 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  32.46 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 261 aa  79.3  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  29.27 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 282 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 260 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>