More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1507 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1507  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 276 aa  550  1e-155  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  41.74 
 
 		 263 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  35.61 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  36.67 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 266 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  35.88 
 
 		 266 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 297 aa  109  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  33.98 
 
 		 261 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  32.82 
 
 		 256 aa  94.4  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  36.76 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 273 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  27.11 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.03 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 267 aa  79.7  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2490  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1270  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3489  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 350 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3295  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.32 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0410  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 300 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.616756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3452  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.880887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3490  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3699  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.258779  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1175  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0585  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0767296  normal  0.0114736 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0617  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558444  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0134  IclR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 365 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.102301  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3009  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.592723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  29.96 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  29.96 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  26.59 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  29.89 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  29.31 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  27.48 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2768  IclR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  30.22 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 268 aa  73.2  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1991  regulatory proteins, IclR  29.58 
 
 		 269 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0527624  normal  0.0427076 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  25.58 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.3 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 262 aa  72  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  24.15 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.34 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.66 
 
 		 259 aa  72  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 264 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0516  transcriptional regulator, IclR family  30.83 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4348  IclR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 128 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560999  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  29.78 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  24.08 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.31 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2181  transcriptional regulator, IclR family  28.99 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169308  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 260 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.9 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0542  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  25.46 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0518  IclR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.689346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  26.72 
 
 		 272 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2024  transcriptional regulator, IclR family  28.82 
 
 		 281 aa  67  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.276218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27 
 
 		 252 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  28.26 
 
 		 262 aa  66.2  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0393  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.701286  normal  0.393158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0050  IclR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.676674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4121  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.101535  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  29.89 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>