More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4348 on replicon NC_008538
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008538  Arth_4348  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  254  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560999  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 266 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  42.02 
 
 		 261 aa  87.4  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  40.34 
 
 		 268 aa  87  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0596  regulatory protein, IclR  39.5 
 
 		 293 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.691457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0686  regulatory protein, IclR  40.65 
 
 		 266 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 277 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1507  transcriptional regulator, IclR family  41.6 
 
 		 276 aa  70.5  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 		 252 aa  70.1  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2795  transcriptional regulator, IclR family  47.75 
 
 		 282 aa  68.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.29633 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 266 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 		 266 aa  63.5  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.04 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  32.76 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18740  transcriptional regulator  33.91 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.691347  normal  0.112015 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 268 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  37.78 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 278 aa  58.9  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  34.91 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  38.37 
 
 		 266 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  34.78 
 
 		 251 aa  57.8  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 276 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  35.34 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  33.66 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1365  transcriptional regulator, IclR family  42.5 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.490803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  34.21 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1668  transcriptional regulator, IclR family  42.5 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.145248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 262 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 261 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  36.45 
 
 		 247 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  26.83 
 
 		 278 aa  53.5  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 275 aa  53.5  0.0000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 275 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 256 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  29.75 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 285 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 276 aa  52.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 260 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 264 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 		 275 aa  52.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  28.1 
 
 		 265 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.11 
 
 		 257 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1583  IclR-type transcriptional regulator  31.15 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2063  transcriptional regulator IclR  26.61 
 
 		 255 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0428372  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0541  transcriptional regulator, IclR family  36.96 
 
 		 261 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.765211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 260 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 260 aa  52.8  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 261 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  31.87 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 263 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 267 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 246 aa  52  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 284 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 263 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0373  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 275 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.78 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2619  IclR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 317 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.471262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 		 261 aa  51.2  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 263 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  26.98 
 
 		 263 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 257 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1684  transcriptional regulator, IclR family  32.8 
 
 		 283 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0925752  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 255 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  37.04 
 
 		 280 aa  51.2  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3321  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 289 aa  50.8  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0186986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 273 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3971  IclR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 301 aa  51.2  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.306814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.91 
 
 		 254 aa  51.2  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 278 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  26.19 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 269 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2384  IclR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 246 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 260 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 263 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  27.97 
 
 		 258 aa  50.4  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 260 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  29.66 
 
 		 268 aa  50.4  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 263 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1171  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 246 aa  50.4  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  26.19 
 
 		 263 aa  50.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5288  regulatory protein, IclR  31.45 
 
 		 278 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.497587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>