More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0947 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
258 aa  525  1e-148  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  46.64 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  46.64 
 
 
266 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  43.6 
 
 
262 aa  209  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  43.53 
 
 
255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 
254 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  41.7 
 
 
255 aa  180  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  40.55 
 
 
257 aa  178  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  38.65 
 
 
254 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  40.7 
 
 
257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 
255 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 
258 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.74 
 
 
258 aa  164  9e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  35.27 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 
264 aa  163  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  36.58 
 
 
256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 
251 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 
258 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 
251 aa  152  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 
255 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  40.73 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  35.22 
 
 
256 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 
258 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  35.34 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
262 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  35.08 
 
 
262 aa  142  5e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  34.82 
 
 
263 aa  142  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  31.87 
 
 
258 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  34.68 
 
 
257 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  34.94 
 
 
277 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 
258 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  34.78 
 
 
249 aa  125  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  32.03 
 
 
254 aa  122  6e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  31.12 
 
 
281 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 
270 aa  121  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  30.36 
 
 
268 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.76 
 
 
261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.05 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  35.09 
 
 
256 aa  112  6e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
260 aa  111  9e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  31.4 
 
 
249 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
272 aa  109  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
254 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
276 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  31.35 
 
 
262 aa  105  5e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 
252 aa  105  6e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
262 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  31.35 
 
 
262 aa  105  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  32.89 
 
 
277 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  30.62 
 
 
265 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 
259 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
260 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 
266 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 
266 aa  102  7e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  32.48 
 
 
248 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
275 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.69 
 
 
254 aa  101  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  30.8 
 
 
279 aa  101  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
260 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
260 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
256 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.52 
 
 
260 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
258 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.52 
 
 
258 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  33.93 
 
 
249 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  30.92 
 
 
248 aa  99.8  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  31.71 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 
262 aa  99  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  27.93 
 
 
251 aa  98.2  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
268 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  29.88 
 
 
267 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.02 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.73 
 
 
246 aa  98.2  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.2 
 
 
258 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
261 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
280 aa  96.7  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 
269 aa  97.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  31.27 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  30.57 
 
 
257 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  31.15 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  28.33 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
257 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  28.57 
 
 
252 aa  93.6  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 
280 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  30.33 
 
 
263 aa  92.8  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
260 aa  92.4  6e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5126  transcriptional regulator, IclR family  33.62 
 
 
255 aa  92.4  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  29.12 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  25.82 
 
 
257 aa  92  9e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>