More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3940 on replicon NC_013923
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 256 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  42.29 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  42.04 
 
 		 264 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  39.15 
 
 		 262 aa  175  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  41.87 
 
 		 263 aa  174  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  41.63 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  41.22 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 251 aa  171  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 262 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 		 254 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.01 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 		 255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  38.74 
 
 		 258 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  39.68 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  38.21 
 
 		 257 aa  161  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  40.4 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  38.62 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 251 aa  151  8e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  38.15 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  37.25 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  34.9 
 
 		 257 aa  142  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  34.55 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  37.29 
 
 		 277 aa  132  6e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 249 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  34.6 
 
 		 269 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 		 260 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  33.98 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 267 aa  119  6e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 259 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.31 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  32.79 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 260 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.92 
 
 		 260 aa  115  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 272 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  35.39 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  35.51 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  34.96 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  32.77 
 
 		 281 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.54 
 
 		 260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.9 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 280 aa  108  7.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 260 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.44 
 
 		 290 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  34.36 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  35.84 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  34.62 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  31.33 
 
 		 275 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  30.92 
 
 		 274 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  34.98 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 258 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 550 aa  103  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.74 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  30.28 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.71 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.98 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.98 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.98 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  30.77 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>