More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0499 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 258 aa  523  1e-147  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  44.78 
 
 		 263 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  47.18 
 
 		 261 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  43.77 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  42.8 
 
 		 270 aa  201  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  45.61 
 
 		 281 aa  192  6e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  40.31 
 
 		 258 aa  188  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  39.45 
 
 		 262 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  39.44 
 
 		 255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  41.63 
 
 		 256 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  40.47 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  42.54 
 
 		 262 aa  176  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  39.11 
 
 		 251 aa  175  8e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  38.7 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  39.37 
 
 		 256 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  37.7 
 
 		 266 aa  172  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  42.26 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  39.59 
 
 		 257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  37.55 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  38.8 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  36.68 
 
 		 272 aa  160  2e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  40.17 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  39.3 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  37.89 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  37.74 
 
 		 254 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  39.38 
 
 		 277 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  39.56 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  34.25 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 251 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  33.07 
 
 		 258 aa  141  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 		 249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  35.47 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  35.2 
 
 		 248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  32.65 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  33.62 
 
 		 276 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 268 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  29.96 
 
 		 280 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  28.74 
 
 		 295 aa  98.6  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 283 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 550 aa  96.3  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 253 aa  95.9  6e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  32.31 
 
 		 279 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  27.51 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 251 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.78 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  30.04 
 
 		 276 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 262 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  27.85 
 
 		 246 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  31.86 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 257 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  31.51 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.06 
 
 		 280 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 269 aa  89  7e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  31.36 
 
 		 285 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.98 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.1 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 284 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.1 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.1 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.1 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.1 
 
 		 274 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.19 
 
 		 277 aa  88.2  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.82 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  30.71 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  31.73 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  28.28 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  28.28 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>