More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0430 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0430  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  511  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0855586  normal  0.805764 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 268 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 272 aa  139  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  32.53 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  33.06 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  34.3 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  32.64 
 
 		 261 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  39.34 
 
 		 254 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  29.58 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 251 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  32.16 
 
 		 251 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 273 aa  122  8e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 251 aa  121  9e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  35.65 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  32.53 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  32.53 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  32.53 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  32.53 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  32.53 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  32.11 
 
 		 274 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  30.36 
 
 		 280 aa  118  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  30.36 
 
 		 280 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  30.36 
 
 		 280 aa  118  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  33.47 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  31.85 
 
 		 275 aa  117  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  35.43 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 283 aa  115  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  36.07 
 
 		 256 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  30.77 
 
 		 279 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  30.58 
 
 		 265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  38.58 
 
 		 276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4383  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0499083 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  32.26 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  31.05 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  33.67 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  31.05 
 
 		 276 aa  112  6e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  31.88 
 
 		 263 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 280 aa  111  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  30.65 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.94 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  31.93 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  31.02 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  35.04 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  34.43 
 
 		 257 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6211  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.253024 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 258 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2177  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00508287  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  31.82 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0211  transcriptional regulator IclR  30.84 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5123  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0198  Transcriptional regulator IclR  33.66 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.101079  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  30.88 
 
 		 290 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1885  transcriptional regulator, IclR family  30.43 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0160572  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  29.35 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  34.42 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.22 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  37.44 
 
 		 258 aa  105  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  34.87 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51350  transcriptional regulator protein DgoR  33.2 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.31 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3261  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  29.02 
 
 		 263 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.31 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  35.53 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  29.31 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  29.31 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>