More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4019 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
258 aa  529  1e-149  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  53.91 
 
 
263 aa  290  2e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  45.85 
 
 
256 aa  232  5e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  42.23 
 
 
255 aa  218  6e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 
254 aa  217  1e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  41.5 
 
 
262 aa  209  4e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  41.41 
 
 
255 aa  204  8e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  43.09 
 
 
264 aa  203  2e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  41.87 
 
 
254 aa  202  4e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  40.16 
 
 
255 aa  202  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  40.71 
 
 
258 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 
256 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  42.34 
 
 
255 aa  189  4e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  42.29 
 
 
256 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  39.15 
 
 
257 aa  185  6e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  38.49 
 
 
262 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  35.74 
 
 
262 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 
272 aa  176  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  40.31 
 
 
258 aa  175  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 
257 aa  175  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 
254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 
268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  36.07 
 
 
277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 
261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  37.24 
 
 
262 aa  171  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 
251 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 
258 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  36.19 
 
 
254 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 
266 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  36.69 
 
 
267 aa  166  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  36.86 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  36.33 
 
 
258 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 
251 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  35.83 
 
 
258 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 
254 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 
250 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  34.11 
 
 
257 aa  148  9e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  34.21 
 
 
256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.76 
 
 
259 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 
249 aa  139  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 
270 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  31.72 
 
 
261 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  34.01 
 
 
249 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  35.25 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
272 aa  125  6e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
263 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30950  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 
277 aa  123  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.648334  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 
254 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 
275 aa  120  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
260 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.03 
 
 
255 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  31.44 
 
 
276 aa  113  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  30.4 
 
 
275 aa  112  7.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  31.95 
 
 
262 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 
266 aa  111  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.59 
 
 
266 aa  111  9e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
259 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 
269 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2981  transcriptional regulator, IclR family  30.99 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  29.69 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  30.56 
 
 
254 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1550  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
276 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  29.31 
 
 
276 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 
252 aa  106  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.33 
 
 
280 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.33 
 
 
280 aa  105  7e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  27.59 
 
 
263 aa  105  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.33 
 
 
280 aa  105  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
283 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  27.39 
 
 
263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  27.39 
 
 
263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  27.39 
 
 
263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  27.39 
 
 
263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 
249 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
267 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  27.39 
 
 
263 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  26.12 
 
 
273 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.45 
 
 
277 aa  103  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.75 
 
 
258 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.45 
 
 
277 aa  102  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
257 aa  102  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
284 aa  102  7e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1062  IclR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
255 aa  101  9e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.154207  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  30.56 
 
 
266 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.14 
 
 
263 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 
274 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 
274 aa  100  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.23 
 
 
274 aa  100  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 
274 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
263 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.14 
 
 
263 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  26.61 
 
 
246 aa  100  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.23 
 
 
274 aa  100  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>