More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0327 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
254 aa  518  1e-146  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  60.39 
 
 
255 aa  313  1.9999999999999998e-84  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  47.84 
 
 
255 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  43.87 
 
 
254 aa  230  2e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  44.84 
 
 
257 aa  219  5e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  43.6 
 
 
255 aa  218  7e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  42.17 
 
 
258 aa  217  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  43.25 
 
 
258 aa  216  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  46.12 
 
 
256 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  42.75 
 
 
255 aa  209  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  42.91 
 
 
263 aa  204  1e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  41.34 
 
 
251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  37.85 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 
254 aa  194  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  39.84 
 
 
258 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  42.74 
 
 
258 aa  193  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  42.28 
 
 
257 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  40.91 
 
 
256 aa  190  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  41.87 
 
 
258 aa  185  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 
266 aa  184  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 
262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  38.78 
 
 
251 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  38.34 
 
 
257 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 
251 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  38.46 
 
 
262 aa  171  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  33.73 
 
 
262 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  38.58 
 
 
275 aa  168  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 
258 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  37.65 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 
250 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  37.96 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  35.89 
 
 
262 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  34.69 
 
 
277 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
267 aa  158  6e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 
254 aa  157  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  40.32 
 
 
256 aa  155  4e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  38.68 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  36.77 
 
 
256 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  34.85 
 
 
261 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
272 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.56 
 
 
255 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  36.51 
 
 
248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  37.05 
 
 
259 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
261 aa  132  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  36.55 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
268 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  30.35 
 
 
268 aa  129  6e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  34.38 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
273 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
260 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
265 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.66 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 
260 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
260 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
254 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  37.07 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  32.94 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  36.95 
 
 
242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 
269 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  35.96 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.14 
 
 
260 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  32.43 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  31.39 
 
 
280 aa  116  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.75 
 
 
260 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  36.32 
 
 
263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  36.36 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0886  transcriptional regulator  30.13 
 
 
280 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.574379  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  32.71 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  30.32 
 
 
252 aa  112  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0202  regulatory proteins, IclR  30.87 
 
 
276 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  30.32 
 
 
252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.95 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
269 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  32.43 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  34.23 
 
 
290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  33.77 
 
 
262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.52 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.5 
 
 
265 aa  109  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 
252 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
256 aa  109  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  29.39 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  35.68 
 
 
276 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  31.47 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.65 
 
 
276 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  31.72 
 
 
267 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 
248 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
251 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3031  regulatory protein, IclR  30 
 
 
276 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>