More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0101 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 249 aa  501  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 		 257 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  38.15 
 
 		 256 aa  141  8e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  37.82 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  36.29 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  34.84 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  36.11 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  36.9 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  36.18 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 262 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  34.01 
 
 		 258 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2861  transcriptional regulator, IclR family  39.26 
 
 		 248 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  35.29 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  35.12 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 254 aa  119  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 267 aa  118  9e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  37.56 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  33.33 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 		 250 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  34.03 
 
 		 258 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  31.89 
 
 		 268 aa  115  7.999999999999999e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  34.31 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  34.67 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  34.07 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  31.17 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 258 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  34.02 
 
 		 275 aa  105  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  33.6 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 256 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  32.39 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 277 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 260 aa  96.7  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  30.49 
 
 		 281 aa  96.3  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  30.54 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 257 aa  95.5  7e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.19 
 
 		 259 aa  94.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 272 aa  94.7  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1714  regulatory protein, IclR  33.06 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.872796  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 260 aa  94  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  29.83 
 
 		 248 aa  92.8  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 257 aa  91.7  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.21 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.75 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  28.7 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  32.02 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 251 aa  87.8  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 261 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 259 aa  86.7  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  28.46 
 
 		 276 aa  86.3  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 277 aa  86.3  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 275 aa  85.5  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  28.05 
 
 		 270 aa  85.1  8e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  32.14 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.28 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  26.73 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  27.23 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.49 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.69 
 
 		 260 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  29.72 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  27.24 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  30.6 
 
 		 267 aa  82  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0440  IclR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 267 aa  81.3  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.38 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.38 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.38 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.38 
 
 		 274 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  28.86 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>