More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4413 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4413  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 251 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4416  transcriptional regulator, IclR family  63.75 
 
 		 251 aa  329  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  45.53 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  43.82 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4759  transcriptional regulator, IclR family  42.56 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.635938  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  41.87 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4694  transcriptional regulator, IclR family  38.68 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.116545  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2238  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.399676  normal  0.216558 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0813  transcriptional regulator, IclR family  43.46 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0808  transcriptional regulator, IclR family  40.65 
 
 		 272 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  37.76 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1087  transcriptional regulator, IclR family  37.45 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0822  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0327  transcriptional regulator, IclR family  39.02 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.720721 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  39.43 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3416  transcriptional regulator, IclR family  39.92 
 
 		 257 aa  165  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0824  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 264 aa  165  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  37.4 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  37.35 
 
 		 254 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  36.59 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3665  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 262 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3532  transcriptional regulator, IclR family  36.61 
 
 		 256 aa  158  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 		 258 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  38.06 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0947  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.264338 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  32.92 
 
 		 262 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2575  transcriptional regulator, IclR family  35.77 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  38.4 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3666  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 		 267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  37.07 
 
 		 268 aa  142  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4784  transcriptional regulator, IclR family  33.88 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.820047  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3940  transcriptional regulator, IclR family  34.51 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4669  transcriptional regulator, IclR family  37.75 
 
 		 275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.86 
 
 		 256 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  38.55 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  32.4 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4139  transcriptional regulator, IclR family  36.17 
 
 		 261 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  35.44 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0499  transcriptional regulator, IclR family  36.32 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4879  transcriptional regulator, IclR family  33.61 
 
 		 277 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3844  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  33.2 
 
 		 259 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  37.61 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  30.74 
 
 		 262 aa  118  7e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  32.39 
 
 		 255 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  34.17 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  30.97 
 
 		 273 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  35 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  29.72 
 
 		 276 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  30.84 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  29.31 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  28.92 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3687  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  28.11 
 
 		 275 aa  109  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3884  transcriptional regulator, IclR family  32.57 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  34.87 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  33.2 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 260 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 260 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.45 
 
 		 276 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  34.91 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.88 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.88 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.88 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0101  transcriptional regulator, TrmB  34.17 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  35.42 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.97 
 
 		 280 aa  105  6e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  34.58 
 
 		 266 aa  105  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  34.31 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  34.31 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  28.02 
 
 		 277 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  34.31 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  34.31 
 
 		 266 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>