More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0179 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0179  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 294 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7063  transcriptional regulator, IclR family  93.88 
 
 		 294 aa  556  1e-157  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4237  IclR family transcriptional regulator  81.29 
 
 		 286 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5595  IclR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.328221 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1109  IclR family transcriptional regulator  73.57 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0131457  normal  0.23204 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1497  IclR family transcriptional regulator  75.09 
 
 		 284 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3988  IclR family transcriptional regulator  75.82 
 
 		 284 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.245997  normal  0.0520052 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3662  IclR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115277  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4705  IclR family transcriptional regulator  73.21 
 
 		 285 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0690054  normal  0.155835 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1332  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0976  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2498  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0315  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.301467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1238  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1311  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512593  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0591  IclR family transcriptional regulator  74.04 
 
 		 284 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.211243  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4099  IclR family transcriptional regulator  72.5 
 
 		 285 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.313873 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4564  IclR family transcriptional regulator  72.14 
 
 		 285 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0119092  hitchhiker  0.000704701 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7055  transcriptional regulator, IclR family  65.23 
 
 		 324 aa  374  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.444053  normal  0.38621 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4229  IclR family transcriptional regulator  67.63 
 
 		 318 aa  374  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.423697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0171  IclR family transcriptional regulator  64.6 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4572  IclR family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000944679 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4107  IclR family transcriptional regulator  66.18 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.0536886 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5587  IclR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 298 aa  359  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152901 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3654  IclR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4713  IclR family transcriptional regulator  67.55 
 
 		 298 aa  360  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  67.41 
 
 		 297 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 310 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 316 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 316 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 316 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  67.95 
 
 		 316 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  353  1e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  68.36 
 
 		 316 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6032  IclR family transcriptional regulator  56.51 
 
 		 279 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4638  transcriptional regulator, IclR family  56.03 
 
 		 275 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.214771  normal  0.0505557 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4506  transcriptional regulator, IclR family  56.03 
 
 		 275 aa  285  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0945557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3573  IclR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 285 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0802291  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3689  IclR family transcriptional regulator  50.92 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.909085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0957  IclR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 295 aa  258  7e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3169  transcriptional regulator, IclR family  51.94 
 
 		 278 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669044  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3598  IclR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0134  IclR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.272177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 268 aa  192  8e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3965  IclR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3476  IclR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  30.98 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.89 
 
 		 260 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0818  IclR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 276 aa  136  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0589352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.5 
 
 		 260 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.5 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 261 aa  134  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 		 265 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  30.71 
 
 		 265 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  34.22 
 
 		 264 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  29.88 
 
 		 278 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3600  regulatory protein, IclR  33.09 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.633228  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3981  IclR family transcriptional regulator family  31.97 
 
 		 280 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.44 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 267 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  30.28 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3662  regulatory protein, IclR  31.27 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3947  IclR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251831 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1166  IclR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 271 aa  119  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3002  transcriptional regulator, IclR family  30.2 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.169737  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 319 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 258 aa  116  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 257 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4454  Transcriptional regulator IclR  29.2 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.387789  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.32 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 263 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 294 aa  112  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2199  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  34.8 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.745324  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0043  transcriptional regulator, IclR family  32.55 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6267  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 259 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  30.28 
 
 		 248 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1265  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4436  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  30.04 
 
 		 257 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3639  IclR family transcriptional regulator family  26.69 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3590  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.19 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 277 aa  109  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 261 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2174  IclR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.598148  normal  0.303207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>