More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0155 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  100 
 
 
243 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11801  transcriptional regulator  62.76 
 
 
248 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128821 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  37.87 
 
 
259 aa  131  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  34.86 
 
 
254 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 
244 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
267 aa  105  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
257 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 
276 aa  98.6  9e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 
266 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20720  transcriptional regulator  35.02 
 
 
263 aa  95.9  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.439734  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  29.91 
 
 
277 aa  95.1  9e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
259 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  28.69 
 
 
276 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  31.38 
 
 
248 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  31.14 
 
 
265 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
284 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  32.93 
 
 
279 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  31.67 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.85 
 
 
280 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.85 
 
 
280 aa  91.7  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.85 
 
 
280 aa  91.7  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  31.36 
 
 
264 aa  91.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  31.82 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0439  transcriptional regulator IclR  31.73 
 
 
286 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.28447 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  30.08 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  36.75 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.15 
 
 
255 aa  90.9  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  32.91 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  28.98 
 
 
276 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  28.81 
 
 
277 aa  89.7  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  34.4 
 
 
271 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  33.01 
 
 
265 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 
265 aa  88.6  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27090  transcriptional regulator  31.38 
 
 
268 aa  88.6  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  33.9 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  33.04 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
256 aa  87.8  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.88 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
267 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  27.87 
 
 
277 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.89 
 
 
259 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  26.42 
 
 
274 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
262 aa  85.9  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
274 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2718  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 
265 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  29.39 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  41.01 
 
 
251 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  29.11 
 
 
258 aa  85.1  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  31.65 
 
 
249 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  26.42 
 
 
275 aa  85.1  9e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3829  transcriptional regulator, IclR family  31.51 
 
 
264 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.602522  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  32.75 
 
 
273 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  31.39 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
238 aa  83.6  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  32.43 
 
 
268 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2053  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
277 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 
254 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  29.29 
 
 
264 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  31.03 
 
 
251 aa  82  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  31.44 
 
 
266 aa  82  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  32.26 
 
 
296 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
276 aa  82  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2873  IclR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.394804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  30 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  31.63 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  27.71 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  32.9 
 
 
249 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  28.07 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  28.07 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  31.98 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.07 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.07 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.07 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  26.11 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  27.01 
 
 
254 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.4 
 
 
277 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
251 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.07 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  28.07 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>