More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51530 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  100 
 
 		 261 aa  521  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2866  regulatory protein, IclR  61 
 
 		 260 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  48.18 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 259 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  40.86 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  37.4 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  37.18 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  36.05 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0155  regulatory proteins, IclR  31.67 
 
 		 243 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 269 aa  89.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3990  hth-type tranScriptional regulator yiaj  30.38 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3865  HTH-type transcriptional regulator  31.06 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4051  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  30.38 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.726111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3881  hth-type tranScriptional regulator yiaj  30.38 
 
 		 266 aa  87.8  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0779  transcriptional regulator IclR  27.6 
 
 		 278 aa  88.2  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  29.24 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3945  HTH-type transcriptional regulator YiaJ  30 
 
 		 266 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.650339 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1099  transcriptional regulator, IclR family  33.64 
 
 		 266 aa  85.1  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00311315  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0978  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0639197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  28.46 
 
 		 280 aa  85.1  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03426  predicted DNA-binding transcriptional repressor  28.87 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4071  IclR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03377  hypothetical protein  28.87 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  29.03 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0136  transcriptional regulator, IclR family  28.87 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2466  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0140  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  29.34 
 
 		 259 aa  83.2  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3897  IclR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2511  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.433919 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  30.17 
 
 		 265 aa  82.8  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2503  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3948  transcriptional regulator, IclR family  29.31 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3778  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  31.23 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  31.68 
 
 		 261 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1621  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.706324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  29.15 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1594  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1534  regulatory protein, IclR  28.23 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1646  IclR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6262  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  33.49 
 
 		 277 aa  80.9  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 260 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3928  IclR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  27.89 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2886  IclR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.187395 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4891  IclR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  28.64 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1836  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0146542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0462  regulatory proteins, IclR  28.22 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4608  IclR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.249268  normal  0.348784 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  27.27 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1249  transcriptional regulator, IclR family  29.53 
 
 		 262 aa  79  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.775121  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  27.43 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  27.03 
 
 		 257 aa  78.6  0.00000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  31.15 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  27.17 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  27.17 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  27.17 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  27.17 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  27.17 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.69 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  29.07 
 
 		 277 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  27.69 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  27.69 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.69 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.69 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  27.94 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0587  transcriptional regulator, IclR family  27.86 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0391803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>