More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0325 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2866  regulatory protein, IclR  45.02 
 
 		 260 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51530  multidrug efflux pump operon transcriptional regulator protein  40.86 
 
 		 261 aa  186  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3492  regulatory proteins, IclR  38.58 
 
 		 258 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2558  IclR family transcriptional regulator  39 
 
 		 249 aa  162  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1334  IclR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 257 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11734  transcriptional regulator  37.96 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  30.45 
 
 		 244 aa  109  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  29.13 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.22 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 262 aa  86.7  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  26.29 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  28.22 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3835  transcriptional regulator, IclR family  29.56 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.790714  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  29.33 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  29.79 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3846  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  26.67 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  28.18 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5080  transcriptional regulator, IclR family  30.66 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2785  IclR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000253598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2997  IclR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  28.34 
 
 		 254 aa  72  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  30.39 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2995  transcriptional regulator, IclR family  26.13 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.71341e-17 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3033  IclR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000487376  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2734  IclR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.16584e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1714  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.760018  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0340  IclR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2739  IclR regulatory protein  29.05 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2606  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.339666  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4369  IclR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2661  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1869  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  26.18 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.22 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3031  transcriptional regulator, IclR family  25.63 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000276549  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4894  regulatory proteins, IclR  27.95 
 
 		 253 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2715  IclR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  26.09 
 
 		 261 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  24.62 
 
 		 255 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  26.43 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3307  IclR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1608  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 265 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0247666  normal  0.511449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  28.49 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0222  Transcriptional regulator IclR  29.02 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.300165  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1936  transcriptional regulator, IclR family  28.7 
 
 		 265 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00885833 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 267 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  27.39 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  30.09 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1955  putative transcriptional regulator  29.05 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  28.69 
 
 		 279 aa  66.2  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8459  transcriptional regulator, IclR family  29.05 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  27.57 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  26.84 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 260 aa  66.2  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  26.26 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23190  putative transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144138 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  29.06 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3036  IclR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2031  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 273 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1610  transcription regulator protein  29.57 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  28.81 
 
 		 266 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  29.87 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7933  transcriptional regulator  28.84 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.829715  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  26.14 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1174  transcriptional regulator, IclR family  29.81 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3087  transcriptional regulator, TrmB  27.8 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.515072  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2518  regulatory proteins, IclR  28.44 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 277 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1371  transcriptional regulator, IclR family  27.23 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000320522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3360  IclR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.233757  normal  0.0607813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  28.64 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>