More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1371 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1371  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 255 aa  502  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000320522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2842  transcriptional regulator, IclR family  90.59 
 
 		 254 aa  431  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.50092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  51.94 
 
 		 254 aa  243  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 255 aa  242  5e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  49.81 
 
 		 256 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  49.02 
 
 		 258 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  45.75 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  44.49 
 
 		 251 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  30.5 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 260 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.96 
 
 		 260 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 260 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  28.85 
 
 		 260 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  27.02 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 261 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  27.2 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 259 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 267 aa  90.9  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  25.38 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  26.48 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  23.83 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  27.69 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  28.25 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 260 aa  79  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  25.5 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  28.76 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  24.22 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2854  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.86 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  24.41 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  29.06 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 265 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  26.01 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  29.41 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 257 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  27.38 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  29.02 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  26.15 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0864  beta-ketoadipate pathway transcription regulator  23.11 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  28.48 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2287  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.481002  normal  0.385963 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0813  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1477  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2130  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.671477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  30.15 
 
 		 277 aa  68.6  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0283  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5059  transcriptional regulator IclR-like protein  26.05 
 
 		 254 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.487025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5569  IclR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.197648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1826  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2006  IclR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 274 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0399  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.425473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4529  IclR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143169 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0497  IclR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 270 aa  67.8  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5560  IclR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  23.14 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2874  transcriptional regulator, IclR family  25.29 
 
 		 267 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  26.38 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3551  IclR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1228  IclR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 267 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00154779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  29.08 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  28.74 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3326  transcriptional regulator, IclR family  28.1 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.021393  hitchhiker  0.00795692 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1885  IclR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  25.46 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1015  IclR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  hitchhiker  0.00000271522 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  28.06 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  23.62 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  25.11 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0681  regulatory proteins, IclR  33.33 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0325  regulatory proteins, IclR  27.23 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.339851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2514  IclR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 277 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4910  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  25.55 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2252  transcriptional regulator, IclR family  39.34 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.128917  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0866  IclR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 260 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0543323  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  24.6 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4923  regulatory proteins, IclR  25.36 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4439  IclR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103527 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  26.64 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4376  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>