More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0532 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0532  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 
253 aa  493  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  62.45 
 
 
246 aa  281  5.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3802  transcriptional regulator, IclR family  61.54 
 
 
264 aa  264  1e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.434289  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4083  transcriptional regulator, IclR family  56.4 
 
 
264 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9117  IclR family transciptional regulator  46.18 
 
 
252 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2885  IclR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
238 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1652  IclR family transcriptional regulator  42.31 
 
 
257 aa  172  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5435  IclR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
249 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.517409 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5832  IclR family transcriptional regulator  46.84 
 
 
249 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2889  regulatory proteins, IclR  43.85 
 
 
299 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.457395  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2133  IclR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
258 aa  161  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  40.08 
 
 
259 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26680  transcriptional regulator  40.87 
 
 
270 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0674048  normal  0.161023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3524  transcriptional regulator, IclR family  41.7 
 
 
296 aa  158  7e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
272 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0315  IclR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
308 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0325  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
286 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.058841  normal  0.452901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0306  IclR family transcriptional regulator  42.45 
 
 
324 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.963545  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15210  transcriptional regulator  44.4 
 
 
257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.577592 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4551  regulatory protein, IclR  40.91 
 
 
276 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.154264 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  35.71 
 
 
256 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.89 
 
 
261 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  38.17 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
267 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  40.96 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
260 aa  144  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4749  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 
253 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2285  transcriptional regulator  37.3 
 
 
261 aa  138  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0510195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
268 aa  138  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  36.28 
 
 
255 aa  137  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  36.82 
 
 
254 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2185  transcriptional regulator, IclR family  40.89 
 
 
259 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3534  transcriptional regulator, IclR family  42.5 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.40867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2824  transcriptional regulator, IclR family  42.06 
 
 
260 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00611258  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2456  transcriptional regulator, IclR family  45.21 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000248538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.82 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3842  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 
251 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.312233  normal  0.510339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3734  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 
251 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3903  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 
251 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.758857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3800  putative transcriptional regulator  35.4 
 
 
251 aa  133  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
254 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1725  IclR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
279 aa  131  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.200124  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4896  transcriptional regulator, IclR family  39.75 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  35.98 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  33.59 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1993  IclR family transcriptional regulator  42.16 
 
 
264 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321176  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 
257 aa  129  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  37.56 
 
 
258 aa  128  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  41.25 
 
 
247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  43.69 
 
 
255 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  33.2 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.64 
 
 
260 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
260 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0569  transcriptional regulator, IclR family  30.7 
 
 
251 aa  123  3e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  31.25 
 
 
260 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.64 
 
 
260 aa  123  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3545  transcriptional regulator, IclR family  40.09 
 
 
254 aa  122  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0480157  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  38.68 
 
 
290 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0559  regulatory proteins, IclR  40.1 
 
 
249 aa  121  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
267 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  38.37 
 
 
265 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4105  transcriptional regulator, IclR family  34.16 
 
 
262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1725  regulatory proteins, IclR  41.67 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.581067  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1741  regulatory proteins, IclR  41.67 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1675  regulatory proteins, IclR  41.67 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3333  transcriptional regulator, IclR family  33.06 
 
 
252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.950577  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1912  IclR family transcriptional regulator  35.87 
 
 
283 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  38.11 
 
 
256 aa  118  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  33.47 
 
 
263 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  36.05 
 
 
251 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5438  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442503  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  33.86 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  35.47 
 
 
242 aa  116  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  35.68 
 
 
259 aa  116  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
268 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3424  transcriptional regulator, IclR family  36.97 
 
 
272 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  34.22 
 
 
255 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2397  regulatory protein, IclR  32.64 
 
 
263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  33.06 
 
 
252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0309456 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2055  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 
263 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0903474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  36.75 
 
 
268 aa  115  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  28.4 
 
 
257 aa  115  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  33.94 
 
 
254 aa  115  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  34.05 
 
 
265 aa  115  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  37.67 
 
 
268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2223  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3097  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.070392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1495  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
270 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684109  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>