More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0302 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0302  transcription regulator protein  100 
 
 		 295 aa  584  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0163  transcriptional regulator, IclR family  81.48 
 
 		 302 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0156  transcriptional regulator, IclR family  80.81 
 
 		 302 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.768394 
 
 
-
 
NC_003296  RS01745  transcription regulator protein  41.89 
 
 		 311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.264626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0113  IclR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 277 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0082  IclR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3279  putative transcriptional regulator  40.23 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4527  transcriptional regulator, IclR family  40.7 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0675359  normal  0.540679 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4659  transcriptional regulator, IclR family  40.7 
 
 		 295 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.880576  normal  0.215321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38500  IclR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4622  IclR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 277 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1125  IclR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 259 aa  178  8e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0448  IclR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 262 aa  177  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4482  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 277 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0361  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 340 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6256  IclR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2913  IclR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0078  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.493125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3215  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0246  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0437  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2928  IclR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2299  IclR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 288 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1348  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.102339  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0195  IclR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0599  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 315 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.125658  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0417  IclR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0909  IclR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0391  IclR family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 288 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.797378  normal  0.0181315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4606  IclR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 262 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0481261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0741  IclR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 260 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2825  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.619636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0581  IclR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2962  IclR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0439  transcriptional regulator, IclR family  40.98 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.545927  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4930  putative IclR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0816  IclR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 260 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0161  transcriptional regulator, IclR family  38.71 
 
 		 290 aa  165  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.567451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0384  IclR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 265 aa  165  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0235844  hitchhiker  0.00703834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0481  transcriptional regulator, IclR family  38.28 
 
 		 300 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121608 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0154  transcriptional regulator, IclR family  39.21 
 
 		 292 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0804  regulatory proteins, IclR  39.04 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000542062  unclonable  0.0000000637978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4236  IclR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.375859 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1516  transcriptional regulator, IclR family  39.76 
 
 		 271 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.371505  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4298  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0300  transcription regulator protein  40.29 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.9672 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5959  IclR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0527246 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0445  IclR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 287 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4674  putative transcriptional regulatory protein  37.65 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0293  transcriptional regulator, IclR family  34.48 
 
 		 287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3598  transcriptional regulator, IclR family  38.89 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3552  transcriptional regulator, IclR family  36.03 
 
 		 263 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0848  transcriptional regulator, IclR family  38.43 
 
 		 275 aa  150  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.130407  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5276  regulatory protein, IclR  39.44 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.945753  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3327  regulatory proteins, IclR  37.9 
 
 		 263 aa  149  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736955 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4533  IclR family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000115279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0689  IclR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 274 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.933931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1458  transcriptional regulator, IclR family  33.87 
 
 		 262 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3632  putative transcription regulator protein  39.43 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0169  regulatory proteins, IclR  33.99 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0724  IclR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.778685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  31.13 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1632  transcriptional regulator, IclR family  35.81 
 
 		 297 aa  122  9e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3528  regulatory proteins, IclR  31.37 
 
 		 265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4215  IclR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 279 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3889  IclR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0628146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3394  regulatory protein, IclR  33.19 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101533  normal  0.0303831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0336  IclR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.780836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4052  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 281 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000104088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4053  IclR family transcriptional regulator  32 
 
 		 269 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0738351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1712  IclR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 549 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  31.05 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0735  regulatory protein, IclR  29.33 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567454 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4304  IclR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 569 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.443184 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3720  IclR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 554 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.261625 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4216  IclR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4196  IclR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 576 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.858157  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4302  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 551 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.750126 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4064  IclR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 551 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1802  IclR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10190  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.413507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3216  IclR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 547 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2208  transcriptional regulator, IclR family  29.86 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4742  regulatory proteins, IclR  27.87 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  25.7 
 
 		 256 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5758  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0425  IclR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 296 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000742162  normal  0.768795 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  30.68 
 
 		 259 aa  102  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1560  regulatory proteins, IclR  29.91 
 
 		 286 aa  102  9e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7212  transcriptional regulator, IclR family  32.13 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.858542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 260 aa  99  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7213  transcriptional regulator, IclR family  31.98 
 
 		 295 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.33644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3148  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 263 aa  99  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.174875  hitchhiker  0.0000000981116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 255 aa  97.8  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2311  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 262 aa  98.2  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.986469  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4095  IclR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 269 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.129203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 260 aa  96.3  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 256 aa  95.1  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>