More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3286 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3286  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1418  regulatory protein, IclR  51.76 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000240863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1072  IclR family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 256 aa  248  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0478344  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0741  IclR family transcriptional regulator  50.2 
 
 		 255 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000156602  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2354  IclR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.185931  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1395  transcriptional regulator, IclR family  42.75 
 
 		 258 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000767969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1371  transcriptional regulator, IclR family  44.49 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000320522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2842  transcriptional regulator, IclR family  44.72 
 
 		 254 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.50092  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  32.17 
 
 		 260 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  32.56 
 
 		 260 aa  135  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  31.78 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  31.23 
 
 		 263 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  31.78 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2873  transcriptional regulator, IclR family  30.89 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0130818 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  31.8 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2308  transcriptional regulator, IclR family  31.58 
 
 		 255 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 257 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  29.96 
 
 		 275 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  27.45 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  28.57 
 
 		 259 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.63 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  29.15 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  30.08 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 267 aa  93.6  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1115  transcriptional regulator, IclR family  30.05 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  31.74 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5128  transcriptional regulator, IclR family  29.46 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 253 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0465  IclR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0093222  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  29.34 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2149  IclR family transcriptional regulator, putative  26.94 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999761  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1825  transcriptional regulator, IclR family  31.33 
 
 		 266 aa  89  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191409  normal  0.0157827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  27.94 
 
 		 257 aa  88.6  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 262 aa  85.9  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  25.2 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2912  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2890  transcriptional regulator, IclR family  30.12 
 
 		 266 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  27.75 
 
 		 277 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01798  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.440803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1918  transcriptional regulator KdgR  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000201259  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  31.56 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1360  transcriptional regulator KdgR  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000169219  normal  0.0136372 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2095  transcriptional regulator KdgR  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000995956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2559  transcriptional regulator KdgR  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000361362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01786  hypothetical protein  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.633166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1805  IclR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.954449  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1340  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2490  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1505  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.18867  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1229  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0968  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1301  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0323  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0600  IclR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6106  IclR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5704 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0668  regulatory proteins, IclR  28.81 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0128525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.85 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  26.56 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  26.43 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  26.43 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.43 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.43 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.43 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  28.97 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  26.43 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.43 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2056  transcriptional regulator KdgR  26.02 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000211216  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  26.43 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2381  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3980  IclR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0269788 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4411  regulatory proteins, IclR  28.11 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.547579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.99 
 
 		 271 aa  79  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2043  transcriptional regulator KdgR  25.61 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.374419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  27.5 
 
 		 268 aa  79  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1985  transcriptional regulator KdgR  25.61 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.364862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1473  transcriptional regulator KdgR  25.61 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0115946  normal  0.370857 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1981  transcriptional regulator KdgR  25.61 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.364283  normal  0.0913734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1289  transcriptional regulator KdgR  25.61 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000107384  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0951  IclR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 268 aa  78.6  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0480  IclR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 259 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0533  transcriptional regulator, IclR family  32.27 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1101  IclR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.250867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  31.4 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 550 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5478  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6599  putative transcriptional regulator, IclR family  31.6 
 
 		 273 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0547312  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  25.1 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>