More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1929 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  100 
 
 		 258 aa  507  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  44.26 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  42.06 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  42.6 
 
 		 261 aa  150  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  38.56 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  36.67 
 
 		 251 aa  136  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  30.61 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 299 aa  97.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  30.8 
 
 		 258 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  28.32 
 
 		 256 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4860  IclR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 274 aa  93.6  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  30.4 
 
 		 294 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2347  IclR family transcriptional regulator  31 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1946  transcriptional regulator, IclR family  32.6 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1776  IclR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 270 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1993  IclR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.080856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3624  regulatory proteins, IclR  31.06 
 
 		 286 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1018  transcriptional regulator, IclR family  28.95 
 
 		 257 aa  90.1  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.142974  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 258 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4201  transcriptional regulator, IclR family  27.76 
 
 		 254 aa  88.2  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4531  IclR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 283 aa  88.6  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.924227  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  28.63 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 260 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0115  transcriptional regulator, IclR family  31.74 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.83 
 
 		 254 aa  86.3  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2376  transcriptional regulator, IclR family  30.53 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 251 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3106  IclR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 270 aa  85.5  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184655 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  29.36 
 
 		 278 aa  85.1  9e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0099  transcriptional regulator, IclR family  30.64 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  23.69 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  29.95 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4433  regulatory proteins, IclR  31.08 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.343959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  26.64 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3754  regulatory protein, IclR  29.15 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6219  IclR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  24.02 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3768  regulatory proteins, IclR  32.37 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000320776  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  31.69 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2872  transcriptional regulator, IclR family  30.26 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  27.86 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  25.79 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  24.9 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  24.9 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4215  transcriptional regulator, IclR family  30.86 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.0022938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  27.03 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3407  transcriptional regulator, IclR family  27.6 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.351965  normal  0.802524 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2906  transcriptional regulator, IclR family  29.26 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1604  IclR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.379428  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  31.09 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6906  IclR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.162528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0868  IclR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 252 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2324  IclR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866935  normal  0.741427 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  31.78 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1075  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1955  IclR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  30 
 
 		 284 aa  78.6  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4280  regulatory proteins, IclR  28.82 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0373374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1723  regulatory proteins, IclR  29.52 
 
 		 259 aa  79  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.270095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4391  transcriptional regulator, IclR family  30.09 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.143749  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  25.96 
 
 		 268 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4595  IclR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4019  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  27.43 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  27.53 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2321  transcriptional regulator, IclR family  28.99 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.383235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2809  transcriptional regulator, IclR family  29.09 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1462  transcriptional regulator, TrmB  28.81 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0663  transcriptional regulator, IclR family  30.29 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1309  IclR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2110  transcriptional regulator IclR-like protein  29.67 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.966848 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  27.27 
 
 		 259 aa  77  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1465  IclR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0393345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0700  IclR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456524  decreased coverage  0.00240678 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0116  IclR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 550 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4056  transcriptional regulator, IclR family  27.92 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1092  IclR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 257 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0515709 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4215  regulatory proteins, IclR  31.6 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4381  transcriptional regulator, IclR family  28.24 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2149  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  27.02 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5945  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2326  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00931512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2132  IclR family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 269 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0887225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0769  IclR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 260 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0526753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>