More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0578 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0578  IclR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  540  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.693979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0571  transcriptional regulator, IclR family  41.06 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.138333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0572  transcriptional regulator, IclR family  40.4 
 
 		 254 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3050  regulatory proteins, IclR  41.25 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1951  transcriptional regulator, IclR family  41.37 
 
 		 261 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1929  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.873364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5069  transcriptional regulator, IclR family  35.8 
 
 		 251 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.469933  normal  0.455404 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  31.25 
 
 		 276 aa  95.9  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2760  IclR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  33.63 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4038  transcriptional regulator, IclR family  32.23 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6211  IclR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 260 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  29.8 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  26.32 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7517  transcriptional regulator, IclR family  32.08 
 
 		 281 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1222  transcriptional regulator, IclR family  29.17 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2032  transcriptional regulator, IclR family  27.73 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.716752  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3676  IclR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 260 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  25.52 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4521  IclR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.948737 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4887  transcriptional regulator, IclR family  28.02 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0696  IclR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.32521  hitchhiker  0.00513536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3456  transcriptional regulator, IclR family  30.24 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2571  regulatory protein, IclR  26.29 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.853506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  28.44 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 251 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4374  transcriptional regulator, IclR family  28.28 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0433228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  28.44 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00456  DNA-binding transcriptional repressor  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.832726  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3106  transcriptional regulator, IclR family  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00461  hypothetical protein  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0440  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0717823  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3116  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.129581 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0580  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0543  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.64 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4000  regulatory proteins, IclR  27.06 
 
 		 294 aa  75.1  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  30.67 
 
 		 264 aa  73.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3712  IclR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  28 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  27.31 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4375  transcriptional regulator, IclR family  30.16 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  26.79 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3174  regulatory protein, IclR  26.51 
 
 		 264 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0501  transcriptional regulator, IclR family  26.4 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  27.08 
 
 		 254 aa  72  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0607  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.22 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0549  DNA-binding transcriptional repressor AllR  25.22 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 272 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  29.8 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2690  transcriptional regulator, IclR family  30.11 
 
 		 267 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000551158  normal  0.164594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1018  regulatory proteins, IclR  30.04 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.069044  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3881  transcriptional regulator, IclR family  26.42 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0445714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 265 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  27.46 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3960  transcriptional regulator, IclR family  30.3 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2412  IclR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2788  transcriptional regulator, IclR family  31.1 
 
 		 276 aa  68.9  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.031926 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  24.89 
 
 		 261 aa  68.9  0.00000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2778  IclR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0655324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2586  transcriptional regulator, IclR family  25.41 
 
 		 268 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119641 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1186  transcriptional regulator, IclR family  24.24 
 
 		 264 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4475  transcriptional regulator, IclR family  24.89 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0192379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1161  transcriptional regulator, IclR family  22.39 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5059  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.941275 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1512  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.388908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2325  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1949  transcriptional regulator, IclR family  27.82 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4647  transcriptional regulator, IclR family  28.16 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  28.51 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1138  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.211589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2032  transcriptional regulator, IclR family  29.33 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  26.96 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4448  IclR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0345876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0740  regulatory protein IclR  25.62 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2042  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2407  IclR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1546  IclR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0208849  normal  0.0159222 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2169  IclR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2653  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618751  normal  0.01576 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3826  transcriptional regulator, IclR family  26.27 
 
 		 278 aa  66.2  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5886  transcriptional regulator, IclR family  32.12 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  26.86 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1793  IclR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1683  transcriptional regulator  27.82 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38610  transcriptional regulator  29.15 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6800  transcriptional regulator, IclR family  31.52 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2122  IclR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000124752  decreased coverage  0.000111832 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0905  IclR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.818194  normal  0.447729 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4730  transcriptional regulator, IclR family  25 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>